L’intrigue commence avec le retour de Gandalf, Aragorn, Legolas, Gimli et des autres compagnons à Minas Tirith, la capitale du Gondor. La ville est assiégée par les forces de Sauron. Aragorn, révélant sa véritable identité d’héritier d’Isildur, prend la tête de l’armée du Gondor pour repousser l’assaut. Pendant ce temps, Frodo et Sam continuent leur quête pour détruire l’Anneau unique. Ils sont accompagnés du mystérieux et menaçant Gollum, ancien possesseur de l’Anneau. Les trois se dirigent vers la Montagne du Destin, le lieu où l’Anneau doit être détruit.
La bataille de Minas Tirith est épique, avec des moments héroïques, notamment le sacrifice de Théoden, le roi du Rohan. Faramir, le frère de Boromir, ancien membre de la Fraternité de l’Anneau, est gravement blessé pendant la bataille, mais finit par se rétablir.
La confrontation finale a lieu à la Montagne du Destin, où Frodo doit faire face à la tentation de l’Anneau. Alors que les survivants de la défense de Minas Tirith affrontent les armées de Sauron à la Porte Noire, Gollum parvient à s’emparer de l’Anneau mais, dans son excitation, glisse et tombe dans les flammes en emportant son « précieux » avec lui. Ainsi, l’Anneau est détruit, et la puissance de Sauron s’effondre, mettant fin à la guerre.
L’ouvrage se termine par le retour des personnages à leurs foyers respectifs. Aragorn est couronné roi, la paix est restaurée et Fraternité de l’Anneau se disperse. Frodon, Sam, Merry et Pippin rentrent dans Le Comté (La Comté dans l’ancienne traduction), mais découvrent que celle-ci a été corrompue par des serviteurs de Saroumane. Ils doivent alors défendre leur territoire contre cette nouvelle menace.
→ À noter que l’ouvrage dispose de plusieurs appendices éclairant le lecteur sur l’histoire et la chronologie de la Terre du Milieu.